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个人信息

博士生导师
研究员

Email: rqye@cemps.ac.cn
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研究方向

植物碳氮代谢与信号转导

叶瑞强

个人简介

2005.9-2009.6 武汉大学生命科学学院，学士
2009.9-2014.6 浙江大学农业与生物技术学院，博士
2010.9-2012.8 北京生命科学研究所，联合培养研究生
2012.8-2015.8 清华大学生命科学学院，联合培养研究生
2015.11-2020.5 美国麻省总医院/哈佛大学医学院，博士后
2020.5-2022.6 美国麻省总医院/哈佛大学医学院，副研究员
2022.7-至今 中国科学院分子植物科学卓越创新中心，研究员

研究工作

植物碳氮代谢驱动着地球生态系统中无机物（CO₂、无机氮）向有机物的转化，构筑了整个生物圈赖以生存与发展的物质与能量基石。因此，提升植物碳氮代谢效率是植物生物学研究的核心命题。本实验室以拟南芥为主要模式植物，结合水稻、大豆等农作物，综合利用分子遗传学、生物化学、化学生物学、合成生物学，以及基因组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学技术，聚焦以下两个研究方向：

(1) 植物碳氮营养感知与响应机制；

碳氮营养除为植物提供物质基础外，本身亦是关键信号分子，广泛调控植物的生长发育与代谢适应过程。然而，植物感知碳氮信号，协调生长与发育，并通过代谢重编程优化物质能量分配的核心分子机制仍不清楚，是亟待阐明的重要科学问题。其中，TOR（雷帕霉素靶蛋白）和 SnRK1（植物AMP激活激酶同源蛋白）作为高度保守的真核生物营养与能量感受枢纽，在植物信号转导网络中居于核心地位。本方向的核心科学问题包括：

    • 植物如何感知碳氮信号并将其传递至 TOR/SnRK1 枢纽？
    • TOR/SnRK1 如何整合上游信号并调控下游的生长发育与代谢网络？
    • 植物表观遗传信息如何动态响应营养信号？
    • 如何设计并优化碳氮信号通路以实现营养物质的合理分配？

（2）植物碳氮代谢跨细胞器协同运转的机制；

为了避免碳氮代谢紊乱，细胞将相关反应区隔于不同的细胞器中进行，犹如功能各异的生产车间。然而，这些细胞器及其代谢反应并非孤立运作，需要代谢物在“车间”间高效穿梭，形成关键的代谢“物流”。因此，代谢物在细胞器间的穿梭效率是决定碳氮高效代谢的关键瓶颈。本方向的核心科学问题包括：

    •鉴定并解析负责碳氮代谢关键代谢物跨细胞器膜转运的转运蛋白。
    •通过理性设计优化细胞器间物质转运效率，最终提升作物的固碳能力和氮素利用效率。

招聘信息：

本研究组长期招聘优秀博士后研究人员，同时热忱欢迎符合要求的联合培养学生和实习生加入，共同探索上述重要科学问题。实验室致力于为青年人才提供充足的科研支持、良好的科研环境及广阔的个人成长空间。有意者请将个人简历及自荐信等材料发送至邮箱：rqye@cemps.ac.cn


主要成果

    1.Cheng Y-J#,Wang,J-W,Ye,R.* (2024) Histone dynamics responding to internal and external cues underlying plant development. Plant Physiology 2024,194(4):1980-1997

    2.Ye,R. # *, Wang,M.,Du,H.,Chhajed,S.,Kol,J.,Liu,K.,Shin,J.,Wu,Y.,Shi,L.,Xu,L.,Chen,S.,Zhang,Y.,Sheen,J.* (2022) Glucose-Driven TOR-FIE-PRC2 signalling controls plant development. Nature 609,986–993

    3.Ye,R. # *,Lin,Z.,Liu,K-H,Sheen,J.,Chen,S.* (2023) Dynamic Proximity Tagging in Living Plant Cells with Pupylation-Based Interaction Tagging. Methods in Molecular Biology 2690,137-147.

    4.Ye,R. #,Chen,Z. #,Bi,L. #,Rowley,MJ,Xia,N.,Chai J,Li,Y.,He,XJ.,Wierzbicki,A.T.,and Qi,Y.* (2016). A Dicer-Independent Route for Biogenesis of siRNAs that Direct DNA Methylation in Arabidopsis. Mol Cell 61,222-35 (Cover story) (*Co-first authors)

    5.Wu,J. #,Yang,Z. #,Zheng,L.,Wang Y.,Ye,R.,Ji,Y.,Zhao,S.,Ji,S.,Xu,L.,Zheng,H.,Jin,L.,Wu,X.,Hong,W.,Wei,C.,Zhou,Yi. Cao,X.,Xie,L.,Wu,Z.,Qi,Y. *,and Li Y.* (2015). Virus-Inducible Argonaute18 Confers Broad-Spectrum Virus Resistance in rice by sequestering a host microRNA. Elife 17;4. doi: 10.7554/eLife.05733. (*Co-first authors;#co-corresponding authors)

    6. Ye,R. #,Wang,W. #,Iki,T.,Liu,C.,Wu,Y.,Ishikawa,M.,Zhou,X.,and Qi,Y.* (2012). Cytoplasmic Assembly and Selective Nuclear Import of Arabidopsis ARGONAUTE4/siRNA Complexes. Mol Cell 46,859-870 (Highlighted in Mol Cell and Faculty of 1000)

    7. Wang,W. #,Ye,R. #,Xin,Y.,Fang,X.,Li,C.,Shi,H.,Zhou,X.,and Qi,Y.* (2011). An importin beta protein negatively regulates MicroRNA activity in Arabidopsis. Plant Cell 23,3565-3576. (Cover story)